天然气水合物的生成和分解都有可能产生灾害。主要有以下三种灾害：
一、油气管道堵塞
　　在高纬度永冻土带及极地地区，水合物的生成可以堵塞诸如油井、油气管道等油气生产设施，从而构成灾害。
二、海底滑坡
　　在海底，天然气水合物是极其脆弱的，轻微的温度增加或压力释放都有可能使它失稳而产生分解，从而影响海底沉积物的稳定性，甚至导致海底滑坡。海底滑坡会对深海油气钻探、输油管道、海底电缆等海底工程设施构成危害。
三、海水毒化
　　一旦海底天然气水合物因突发因素而失稳分解，大量的甲烷气体将进入海水，结果是海水被还原，造成缺氧环境，进而引起海洋生物大量死亡，甚至导致生物绝灭事件发生。
天然气水合物的合成与分解实验：