氨基酸的分类具有多种方法：
　　（1）根据其结合基团不同的氨基酸分类：可将氨基酸分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸、杂环氨基酸、含硫氨基酸、含碘氨基酸等。
　　脂肪族氨基酸：丙、缬、亮、异亮、蛋、天冬、谷、赖、精、甘、丝、苏、半胱、天冬酰胺、谷氨酰胺
　　芳香族氨基酸：苯丙氨酸、酪氨酸
　　杂环族氨基酸：组氨酸、色氨酸
　　杂环亚氨基酸：脯氨酸
　　（2）根据人体所需的氨基酸分类：可将氨基酸分为非必需氨基酸和必需氨基酸两大类。
　　必需氨基酸指的是人体自身不能合成或合成速度不能满足人体需要，必须从食物中摄取的氨基酸。它是人体（或其它脊椎动物）必不可少，而机体内又不能合成的，必须从食物中补充的氨基酸，称必需氨基酸。对成人来讲必需氨基酸共有八种：赖氨酸、色氨酸、苯丙氨酸、蛋氨酸、苏氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、缬氨酸。如果饮食中经常缺少上述氨基酸，可影响健康。它对婴儿的成长起着重要的作用。对婴儿来说，组氨酸也是必需氨基酸。
　　非必须氨基酸指的是可在动物体内合成，作为营养源不需要从外部补充的氨基酸。一般在植物、微生物必需的氨基酸均由自身合成，这些都称为非必需氨基酸。对人来说非必需氨基酸为甘氨酸、丙氨酸、丝氨酸、天冬氨酸、谷氨酸（及其胺）、脯氨酸、精氨酸、组氨酸、酪氨酸、胱氨酸。这些氨基酸由碳水化合物的代谢物或由必需氨基酸合成碳链，进一步由氨基转移反应引入氨基生成氨基酸。已知即使摄取非必需氨基酸，也是对生长有利的。体内需要，但体内能自己合成的氨基酸.这类氨基酸不必由食物供给.在蛋白质中常见的２０种氨基酸中，除了８种必需氨基酸，其余的１２种都是非必需氨基酸。非必需氨基酸的供给对于必需氨基酸的需要量是有影响的。例如，体内的酪氨酸（非必需氨基酸）可由苯丙氨酸转变而成，半胱氨酸可由蛋氨酸转变而成。因此，当膳食中酪氨酸和半胱氨酸的含量丰富时，体内可以不必耗用苯丙氨酸和蛋氨酸转变成这两种非必需氨基酸。同时苯丙氨酸和蛋氨酸的需要量也会减少，所以将酪氨酸和半胱氨酸称为半必需氨基酸。
　　（3）根据化学性质分类的氨基酸分类：可将氨基酸分为酸性氨基酸、碱性氨基酸、中性氨基酸。