水生生物学：是研究水环境中生命形象和生物学过程规律的一门学科。水环境有淡水与海洋之分，所以，水生生物学可以涵盖淡水生物学和海洋生物学这两门学科的内容。
渔业生物学：渔业生物学是水生生物学的一部分，它主要研究鱼类种群的生物特性及其与环境的相互关系，进而阐明渔业的经济性和合理性。
水文学：水文学是探求地球上自然界中水的各种现象和运动规律的科学。按照研究对象可分为海洋水文学和陆地水文学。
生态学：生态学是研究生物或者生物群体及其环境的关系，或者是生活着的生物及其环境之间相互联系的科学。
生态工程学：生态工程学就是利用生态控制论原理，促进资源综合利用，环境综合整治，及人的综合发展的科学。
景观生态学：景观是指由相互作用生态系统的聚合组成的异质土地面积，以相似的形式在整个面积重复着。景观生态学就是研究由相互作用生态系统组成的异质地表的结构，功能和变化的科学。
流域生态学：流域生态学以流域为单位，应用现代生态学的理论和系统科学的方法，研究流域内高地、沿岸带、水体等各子系统间的物质、能量、信息流动规律，在研究流域作为一复合生态系统的结构和功能之基础上，进一步从中、大尺度上对流域内各种资源的开发利用，保护及环境问题进行研究，为流域中陆地和水体的合理开发利用决策提供理论依据，从而为区域的社会经济可持续性发展作出贡献。
系统生态学：系统生态学是运用系统理论，系统分析与模拟手段，从能学角度研究生态系统的结构与功能的学科。
经济生态学：经济生态学是研究生态学的各类生态系统、种群、群落、景观、生物圈过程与经济过程相互作用方式，调节机制及其经济价值的体现。
淡水生态学：淡水生态学的研究对象为河流、湖泊、水库、溪流、湿地等内陆淡水水体，是研究淡水生态系统特征的学科，与其相对的是海洋生态学。
保护生物学：保护生物学是一门综合性学科，目标是评估人类对生物多样性的影响，提出防止物种灭绝的具体措施。
环境生物学：环境生物学是研究异常环境条件与生物之间的相互关系的科学。所谓的异常环境即包括污染条件，也包括过度或不足的正常环境条件。
水污染生态学：水污染生态学是研究污染物质对水生生物影响的学科。其研究范围包括水质生物监测和评价，水体污染物的毒性和毒理的研究，污水生物净化的研究，以及湖泊富营养化的研究。
微生物污染生态学：微生物污染生态学主要侧重于应用微生物处理废水的研究和利用氧化搪和土地处理系统处理污水的研究。
淡水辐射生态学：淡水辐射生态学是研究放射性物质在淡水生态系统中的循环及辐射对淡水生态系统的影响的学科。
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