与神舟1号试验飞船相比，神舟2号飞船的系统结构有了新的扩展，技术性能有了新的提高，飞船技术状态与载人飞船基本一致。神舟2号首次在飞船上进行了空间天文和空间物理及微重力环境下的空间生命科学、空间材料、等领域的实验，其中包括：半导体光电子材料、氧化物晶体和合金等多种材料的晶体生长实验；蛋白质和其他生物大分子的晶体生长实验；植物、动物、水生生物、微生物及离体细胞和细胞组织的空间环境效应实验等。飞船在轨运行期间，各种试验仪器设备性能稳定，工作正常，取得了大量宝贵的飞行试验数据。