近年来，中国保护大熊猫研究中心与兄弟单位展开了一系列科研合作，陕西楼观台的“白雪”在卧龙已成功产下3胎5仔，这些合作是提高大熊猫繁殖率和遗传多样性必不可少的途径。

　　与四川农业大学合作对大熊猫毛发中生殖激素水平进行了研究，完成了阶段性工作。

　　与北京师范大学合作对圈养大熊猫和野生雉类的行为生态作了进一步研究。

　　与山西省农业科学研究院合作，特聘山西省农科院研究员曹家林先生对大熊猫等珍稀动物的声谱作了进一步研究，完成了阶段性工作。

　　与东北林业大学合作，进行了西伯利亚红松引种试验，育种工作已基本完成，幼苗生长良好。

　　同美国密执安大学及中国科学院生态环境研究中心合作开展“GPS（全球卫星定位系统）在卧龙自然保护区的应用研究”，共作样方200多个，并建立了两个GPS定位站，为卧龙今后调查野生动植物种源打下了坚实的基础。

　　1997年、1999年在卧龙成功主办了“大熊猫放归野外可行性国际研讨会”、“大熊猫保护分析和研究技术研讨会”。

与美国、日本等国外机构的合作　　攻克了大熊猫繁育中的“三大难关”