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有的鱼类在泥质底部掘泥筑巢，如黄颡鱼、棒花鱼、罗非鱼等。黄颡鱼的雄鱼具有营窝的习性，在生殖期间，雄鱼游到沿岸地带水草茂密的淤泥粘土处（水深8-40厘米），利用胸鳍刺在泥底上断断续续地转动，掘成一个小小的泥坑即为鱼巢，有的几个在一起，也有几十个成群，相隔不远而形成穴群。有的鱼类在石砾底部筑巢，如大麻哈鱼、七鳃鳗、青海湖裸鲤。大麻哈鱼到达产卵场后，选择环境僻静，水质澄清，水流湍急，水温适中，水底为砂砾质的地方，雄鱼用尾鳍拍打砂砾，借水流的冲击，形成一个直径为1米，深约20厘米的坑，这种巢称为“卧子”。
雌鱼产卵于卧子内，并已尾鳍反复拨动砂砾，将卵埋好。七鳃鳗的产卵场所类似于大麻哈鱼，雄鱼先行到达产卵场后，先行选择场地开始筑巢，雌鱼随后到达后一同工作。它们用吸盘状的口吸起小石，用拖和震的方法使其松散并拖到巢的下游方，筑成一推，在河底形成一个直径50-80厘米，呈卵圆形或圆形的凹陷坑，这就是它们的产卵巢。青海湖裸鲤在生殖季节，雄鱼用臀鳍和尾鳍将河底的砂砾扫刮成浅坑，产出的卵多数集于坑中。
 刺鱼等用水草筑巢
鰕虎鱼能造隐蔽巢
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